Non-Coding RNA Search

Lng1-LNG010066B11

Sequence:


               
               TTATGACAAATGAAAACTTTGCCTTTTTATCTATTTCTCTTTTAACTGTTAAAAAAGATC
TCTTTTACTGTAAAATATAACACATATGTAACTTTTGAAATGTAAATGTAGAGTTCAATG
AATTATTTAAAAAGTGAACATCTTTGTAACTACCTCCCAGCTCAAGAAATAGGACAGTTT
CACCCCTCCCCCCCACCAAAGGAATCTTTATTTGTTAGGTGCTTGGTTTTCTTTTCGGGG
AAGTTATGAGTAATAGCAAGAGGCAATTATAAATATTTTCAGGTCCCAAATATGTGCTTC
TTTGAGTGGAATTAGATCAAAGGTGTAATATTAATGTTTTATTCTGTAATTATTTCTTAT
TTCTATAATTATGAATTTGTAAGTCCTGGGTTTCCAGCCTTAAAGATCAAAATCTTTGGG
CTCCCGGTTGTCAGATTTTGTGTCCTTTGAAAGGGAGTGAAAAAGTTGTGATCCTTGGAG
TGTGAGAAAATGTCTCATGCTTAATTATTTTTTAAATGTTCTGACCATCGCTCCTTTACC
TGTTGTTGGAAGCACAATAAATAAGACTCCAGTGTTGATGAGGACTTTGTACAGTAGTCA
AAGTTCTTCTTAGAAATACTTGACCCTTATCAGAGAAAACACCAATTATAGTAGAGCACT
CTAAATTCTACCACCTTTGAAAGCTTAATTCATGAATTAATAAATCACAAGTCTTCTGTG
GTATCCAGGAAAGGATGCTCTTGAATAACTTTTTAATGATTAAGTCAGAAAATGATGGTA
AACATTAAAATAATTGGGAAAGTATCTTAGCTAGTCAGATATGTCTGTAAAACAGAAAAG
CTACGAGTATTTTAAAAATGGATAAAGAAGGGCTC

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               TTATGACAAATGAAAACTTTGCCTTTTTATCTATTTCTCTTTTAACTGTTAAAAAAGATC
TCTTTTACTGTAAAATATAACACATATGTAACTTTTGAAATGTAAATGTAGAGTTCAATG
AATTATTTAAAAAGTGAACATCTTTGTAACTACCTCCCAGCTCAAGAAATAGGACAGTTT
CACCCCTCCCCCCCACCAAAGGAATCTTTATTTGTTAGGTGCTTGGTTTTCTTTTCGGGG
AAGTTATGAGTAATAGCAAGAGGCAATTATAAATATTTTCAGGTCCCAAATATGTGCTTC
TTTGAGTGGAATTAGATCAAAGGTGTAATATTAATGTTTTATTCTGTAATTATTTCTTAT
TTCTATAATTATGAATTTGTAAGTCCTGGGTTTCCAGCCTTAAAGATCAAAATCTTTGGG
CTCCCGGTTGTCAGATTTTGTGTCCTTTGAAAGGGAGTGAAAAAGTTGTGATCCTTGGAG
TGTGAGAAAATGTCTCATGCTTAATTATTTTTTAAATGTTCTGACCATCGCTCCTTTACC
TGTTGTTGGAAGCACAATAAATAAGACTCCAGTGTTGATGAGGACTTTGTACAGTAGTCA
AAGTTCTTCTTAGAAATACTTGACCCTTATCAGAGAAAACACCAATTATAGTAGAGCACT
CTAAATTCTACCACCTTTGAAAGCTTAATTCATGAATTAATAAATCACAAGTCTTCTGTG
GTATCCAGGAAAGGATGCTCTTGAATAACTTTTTAATGATTAAGTCAGAAAATGATGGTA
AACATTAAAATAATTGGGAAAGTATCTTAGCTAGTCAGATATGTCTGTAAAACAGAAAAG
CTACGAGTATTTTAAAAATGGATAAAGAAGGGCTC

Aligned organism(s): 7 entry(ies)

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Aligned organism(s): 7 entry(ies)

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               1-247, gnl|bosTau2|chr26 (6215635-6215381)
               

               
               1-247, gnl|Hg17|chr10 (92923085-92923369)
               

               
               1-247, gnl|Mm7|chr19 (36059018-36059266)
               


               
               262-643, gnl|bosTau2|chr26 (6215389-6215006)
               

               
               262-643, gnl|Hg17|chr10 (92923361-92923761)
               

               
               262-643, gnl|Mm7|chr19 (36059258-36059674)
               


               
               645-867, gnl|bosTau2|chr26 (6214916-6214689)

Aligned organism(s): 7 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               1-247, gnl|bosTau2|chr26 (6215635-6215381)
               

               
               1-247, gnl|Hg17|chr10 (92923085-92923369)
               

               
               1-247, gnl|Mm7|chr19 (36059018-36059266)
               


               
               262-643, gnl|bosTau2|chr26 (6215389-6215006)
               

               
               262-643, gnl|Hg17|chr10 (92923361-92923761)
               

               
               262-643, gnl|Mm7|chr19 (36059258-36059674)
               


               
               645-867, gnl|bosTau2|chr26 (6214916-6214689)

	1-247, gnl\|bosTau2\|chr26 (6215635-6215381)
	1-247, gnl\|Hg17\|chr10 (92923085-92923369)
	1-247, gnl\|Mm7\|chr19 (36059018-36059266)

	262-643, gnl\|bosTau2\|chr26 (6215389-6215006)
	262-643, gnl\|Hg17\|chr10 (92923361-92923761)
	262-643, gnl\|Mm7\|chr19 (36059258-36059674)

	645-867, gnl\|bosTau2\|chr26 (6214916-6214689)