Pig3-SRG8019L16
               |  | ACTggatccaagccacatctgcaaccactatcacagctcacagccattccagatccttaa
cccactgagcaaggccagggattgaacccacatcctcatggatactagttggatttgtta
ccactgagccataatgggaactccTCTTTTCATTTTTTCAATGGGGGCCCTTTTTTTGTT
AGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGAGAGTCTCAACCATggcatgtggagcttcccatgct
aaagatggaatcagagctacagcttccggcctacgccacagctcacggcaacgtcggatc
cttaacccacggagcaaggccagggatggaacccatatccccatggatcctaagtgggtt
cgttcacccctgagccacgatgggagctccTTAATGGTTTCCTTTGCTGTAAAAGCACGT
GCGTTTGAAGAGGTCTCATTTGCTTATTTTTGCTTTTATTTCTCTTGCCCTGAGACATTG
ACCTAAGAAGACCTTGGTAAAATGCGTCAGAGAATGTTCTGCCTGTGTTCTCTTCTAAGA
GTTTCGTGGCGTCTTGTCTTGTGT | 
Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz
               |  | ACTggatccaagccacatctgcaaccactatcacagctcacagccattccagatccttaa
cccactgagcaaggccagggattgaacccacatcctcatggatactagttggatttgtta
ccactgagccataatgggaactccTCTTTTCATTTTTTCAATGGGGGCCCTTTTTTTGTT
AGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTGAGAGTCTCAACCATggcatgtggagcttcccatgct
aaagatggaatcagagctacagcttccggcctacgccacagctcacggcaacgtcggatc
cttaacccacggagcaaggccagggatggaacccatatccccatggatcctaagtgggtt
cgttcacccctgagccacgatgggagctccTTAATGGTTTCCTTTGCTGTAAAAGCACGT
GCGTTTGAAGAGGTCTCATTTGCTTATTTTTGCTTTTATTTCTCTTGCCCTGAGACATTG
ACCTAAGAAGACCTTGGTAAAATGCGTCAGAGAATGTTCTGCCTGTGTTCTCTTCTAAGA
GTTTCGTGGCGTCTTGTCTTGTGT |