Non-Coding RNA Search

Pig4-TMW8019E23

Sequence:


               
               TTTTATATGTACCATGCAGCTAAAGACGTAATGTGCATTGGGTATGTGATAAGGAATCTG
TGTGAAAAGGTGCTTGTGTTTTTTATTTTGCCAGAATACTGTAATGCAGTTTCATCTGAT
TTTTATGTCACAGGTCAAATCTAATTAGTTTTTTTTTGTGGTCTTAATAAATGTATGTTA
AATGACCTGATTTATCAGCATTTTGTAGAGTCTATATTTTGTTTTGGTAAAACAAAACTC
CACAGTAACCCAGAGTCATTTGTGAATGATAGTAAGTGAGAGGTCAGTTAGGGCCCTTAC
TATCCCATACTGATTACATGATTTTAAAGTATTCTTCAAAGCATCCTCATTTAAAATGCA
TTGAACTATATTTAAGGTTTTAGAATCACTGATGAGTGTGTTTTAGCGTTAATTTGTTAA
TATCAGACTGGTTCTAAAGCAGTAGCCTGAAGTGTGGGCAGTGTTTCTCACTCTCTCTCG
CTCATCAACTGTGTTAGAAAACCTTGTACTTGGATGCAGAGAGCAGATTAACAGCTGTGA
CTATGAGCTTGTGCCAGAATGGCGATACTTGAGCAGATCTGACACTTGGCTATTTTTGAC
ACCCATCTGCACTTTTTAAACTCTACTATGGGTCAGACTCCCTCTTAATAGGTTTTTAGC
ACATTTTAGCCCATACATATGTATTTAAATGAGTGGACTTAATTTATCATCTGGGACAGA
TTTTACATTTTTAAAATAAGACATGATGTATAGAAGATTAAAAGGATGTGTTTCAGGTAA
TGTGATATTGTCACTTTTTTATTTTTCAATTCGACTAAATAATTATATATCAACACTTCT
TATCATTTTTCTGTAGGTCAGGTGTTAGAATTTGCTCCTGCT

Sequence:

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Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               TTTTATATGTACCATGCAGCTAAAGACGTAATGTGCATTGGGTATGTGATAAGGAATCTG
TGTGAAAAGGTGCTTGTGTTTTTTATTTTGCCAGAATACTGTAATGCAGTTTCATCTGAT
TTTTATGTCACAGGTCAAATCTAATTAGTTTTTTTTTGTGGTCTTAATAAATGTATGTTA
AATGACCTGATTTATCAGCATTTTGTAGAGTCTATATTTTGTTTTGGTAAAACAAAACTC
CACAGTAACCCAGAGTCATTTGTGAATGATAGTAAGTGAGAGGTCAGTTAGGGCCCTTAC
TATCCCATACTGATTACATGATTTTAAAGTATTCTTCAAAGCATCCTCATTTAAAATGCA
TTGAACTATATTTAAGGTTTTAGAATCACTGATGAGTGTGTTTTAGCGTTAATTTGTTAA
TATCAGACTGGTTCTAAAGCAGTAGCCTGAAGTGTGGGCAGTGTTTCTCACTCTCTCTCG
CTCATCAACTGTGTTAGAAAACCTTGTACTTGGATGCAGAGAGCAGATTAACAGCTGTGA
CTATGAGCTTGTGCCAGAATGGCGATACTTGAGCAGATCTGACACTTGGCTATTTTTGAC
ACCCATCTGCACTTTTTAAACTCTACTATGGGTCAGACTCCCTCTTAATAGGTTTTTAGC
ACATTTTAGCCCATACATATGTATTTAAATGAGTGGACTTAATTTATCATCTGGGACAGA
TTTTACATTTTTAAAATAAGACATGATGTATAGAAGATTAAAAGGATGTGTTTCAGGTAA
TGTGATATTGTCACTTTTTTATTTTTCAATTCGACTAAATAATTATATATCAACACTTCT
TATCATTTTTCTGTAGGTCAGGTGTTAGAATTTGCTCCTGCT

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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               2-880, gnl|bosTau2|chr14 (45450333-45449469)
               

               
               2-880, gnl|Hg17|chr8 (93142799-93141896)
               

               
               2-880, gnl|Mm7|chr4 (13713371-13714438)

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               2-880, gnl|bosTau2|chr14 (45450333-45449469)
               

               
               2-880, gnl|Hg17|chr8 (93142799-93141896)
               

               
               2-880, gnl|Mm7|chr4 (13713371-13714438)

	2-880, gnl\|bosTau2\|chr14 (45450333-45449469)
	2-880, gnl\|Hg17\|chr8 (93142799-93141896)
	2-880, gnl\|Mm7\|chr4 (13713371-13714438)