Non-Coding RNA Search

Pig4-TMW8038B20

Sequence:


               
               ACATAACTACTCGGCGTTGCTTCTACaggggtccaatctgagctatagctgctggcctac
accacagctcacagcaatgccagatgcttaacccactgagcaaggccagggatcaaacct
gcaacctcatggttcctattcggattcgtttttgctgagccatgacgggaagtccAAGAC
TGTTGTCTTTTTCAAATTTGTATCTGAATTTTCATGTTGCTGTTTATTAAGATATGTATT
TTATGTATGTCATTAAGTGTAGTTGTACTGGTTTTTAGCAAAATGTTCAACTCTGCTACC
TGTAGTACTTTAGCATTAGGTAGCTCTTTATTGGAAGAGTAATCTTAGTAGTTAGAAGTT
TTTTTAAAAACAGCTACATGAGGACGGGAAGTAGTCCAATGAGGATGATAGAGAAATTAG
TCTAAGTTTGCCGTAGATAATCAAGAATGAACTAACTTAAAATTTAGTCTTTGCCACTAA
TAGTTTGAACTAAGGCATCCTTGAGTTAAAAATGGACATTGGTGGTTTAAAATGGTAGAA
GTCAGACATTGAATATATTGAAAATGTTGTGAATTAACATTTCCTTCCAGTCATAAGATA
TTTTTTATTTTGCTATTATCTCAAAATTATGTTCATTTGGCTATAAATTAATGTAGAGGT
CTTTAATTCCCATTATAGCCTTAATGTTTAGGAGACTTTGGGACCTTGGTAATAGAATTA
GAAATATATGGGTCATAGTTAAATTCCCTGTGAGTAATGACTCTCCTCCCAGACCTGACC
AGACAAAACCCTGTGAAACCTGTGGTCAGATTCTAAGACAGCAGTGAGAGCCCCAGCTGC
CTTTGAGTGGTATTAGGGGAGCCAATGG

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               ACATAACTACTCGGCGTTGCTTCTACaggggtccaatctgagctatagctgctggcctac
accacagctcacagcaatgccagatgcttaacccactgagcaaggccagggatcaaacct
gcaacctcatggttcctattcggattcgtttttgctgagccatgacgggaagtccAAGAC
TGTTGTCTTTTTCAAATTTGTATCTGAATTTTCATGTTGCTGTTTATTAAGATATGTATT
TTATGTATGTCATTAAGTGTAGTTGTACTGGTTTTTAGCAAAATGTTCAACTCTGCTACC
TGTAGTACTTTAGCATTAGGTAGCTCTTTATTGGAAGAGTAATCTTAGTAGTTAGAAGTT
TTTTTAAAAACAGCTACATGAGGACGGGAAGTAGTCCAATGAGGATGATAGAGAAATTAG
TCTAAGTTTGCCGTAGATAATCAAGAATGAACTAACTTAAAATTTAGTCTTTGCCACTAA
TAGTTTGAACTAAGGCATCCTTGAGTTAAAAATGGACATTGGTGGTTTAAAATGGTAGAA
GTCAGACATTGAATATATTGAAAATGTTGTGAATTAACATTTCCTTCCAGTCATAAGATA
TTTTTTATTTTGCTATTATCTCAAAATTATGTTCATTTGGCTATAAATTAATGTAGAGGT
CTTTAATTCCCATTATAGCCTTAATGTTTAGGAGACTTTGGGACCTTGGTAATAGAATTA
GAAATATATGGGTCATAGTTAAATTCCCTGTGAGTAATGACTCTCCTCCCAGACCTGACC
AGACAAAACCCTGTGAAACCTGTGGTCAGATTCTAAGACAGCAGTGAGAGCCCCAGCTGC
CTTTGAGTGGTATTAGGGGAGCCAATGG

Aligned organism(s): 4 entry(ies)

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Aligned organism(s): 4 entry(ies)

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               218-336, gnl|bosTau2|chr16 (17448137-17448251)
               

               
               218-336, gnl|Hg17|chr1 (222561704-222561810)
               


               
               367-841, gnl|bosTau2|chr16 (17448358-17448832)
               

               
               367-841, gnl|Hg17|chr1 (222562331-222562769)

Aligned organism(s): 4 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               218-336, gnl|bosTau2|chr16 (17448137-17448251)
               

               
               218-336, gnl|Hg17|chr1 (222561704-222561810)
               


               
               367-841, gnl|bosTau2|chr16 (17448358-17448832)
               

               
               367-841, gnl|Hg17|chr1 (222562331-222562769)

	218-336, gnl\|bosTau2\|chr16 (17448137-17448251)
	218-336, gnl\|Hg17\|chr1 (222561704-222561810)

	367-841, gnl\|bosTau2\|chr16 (17448358-17448832)
	367-841, gnl\|Hg17\|chr1 (222562331-222562769)