Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Ova1-OVRM10069B01.5

Sequence:


               
               ACAGGTTGCAGAGACAACACCAAAAATGTGTTTTGCCCCCCTTGGAAACAGCTGTCAGTG
CATTTCATATTCTAAGACGCTTCTCTTCCATGGCTCAGGATCCTCTTGTTCTAAGATGGA
AATAATTATGATGTATATGGTCTCAGTTTTCAGGAGCCATTTATATTTAGTCGTATTAAA
CGGTTATTACATTTGCTGCGTGTATGTCCGCTGGCTTCGTTTCATTTTTATTGTTTATAT
ATGAGATACAGGAGTTATCATTTTCATTTGTTCAGATCTTTTTCCTTTTTTCTTTATATG
TCTTCAAAGATTAGAAAGTCAGTTCCCTGGAGATATTTAATAAATGTTCTCTCCTGTCAT
CTGCTTTTTGTAGGTTTTCAACATTTTTAAACTAAGTAATCCATCTGGAATTAATTTGCT
GTAGGGATGATATATTATTTTATGTCAGTTAAGACAGTTTATTCATTTTTAAAGGTTACT
TATGCTTTGAGAGTCTTTATCTTTCCTCTTTAAATTGCCTAGTCTATGCTGGCTTTTTAA
AAATTTGGTAGATACTGATCTATGGTTATATTCCAGATTTTGTTTGAAGTGCCATCCTTG
CTAATTTTTATGGTTATTGACTGTAACGTGTACTTCTATTTTTAACTATCTTTGAAGTGC
CTTTCCAAAGGCATTTTACCTCCTTTTTTAATTGAAAAATCTAGGATGTCATGTTGAGAT
CTGGGTTGATGTTAAGACCTTTTGATGTTAACTAACAAATAGGTACAAGTTCAGTATTGA
TGCGTGCGTCTCTGTTAACTGCTTTTTATGTGCAGGTCCACAAAGGACAGTTACGATTTT
CATTCTTTATTTAGTTTAGTCATGGGAGTGACTGTCTTGAGTAATGGG

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               ACAGGTTGCAGAGACAACACCAAAAATGTGTTTTGCCCCCCTTGGAAACAGCTGTCAGTG
CATTTCATATTCTAAGACGCTTCTCTTCCATGGCTCAGGATCCTCTTGTTCTAAGATGGA
AATAATTATGATGTATATGGTCTCAGTTTTCAGGAGCCATTTATATTTAGTCGTATTAAA
CGGTTATTACATTTGCTGCGTGTATGTCCGCTGGCTTCGTTTCATTTTTATTGTTTATAT
ATGAGATACAGGAGTTATCATTTTCATTTGTTCAGATCTTTTTCCTTTTTTCTTTATATG
TCTTCAAAGATTAGAAAGTCAGTTCCCTGGAGATATTTAATAAATGTTCTCTCCTGTCAT
CTGCTTTTTGTAGGTTTTCAACATTTTTAAACTAAGTAATCCATCTGGAATTAATTTGCT
GTAGGGATGATATATTATTTTATGTCAGTTAAGACAGTTTATTCATTTTTAAAGGTTACT
TATGCTTTGAGAGTCTTTATCTTTCCTCTTTAAATTGCCTAGTCTATGCTGGCTTTTTAA
AAATTTGGTAGATACTGATCTATGGTTATATTCCAGATTTTGTTTGAAGTGCCATCCTTG
CTAATTTTTATGGTTATTGACTGTAACGTGTACTTCTATTTTTAACTATCTTTGAAGTGC
CTTTCCAAAGGCATTTTACCTCCTTTTTTAATTGAAAAATCTAGGATGTCATGTTGAGAT
CTGGGTTGATGTTAAGACCTTTTGATGTTAACTAACAAATAGGTACAAGTTCAGTATTGA
TGCGTGCGTCTCTGTTAACTGCTTTTTATGTGCAGGTCCACAAAGGACAGTTACGATTTT
CATTCTTTATTTAGTTTAGTCATGGGAGTGACTGTCTTGAGTAATGGG

Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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               11-720, gnl|bosTau2|chr6 (12994119-12993403)
               

               
               11-720, gnl|Hg17|chr4 (95759159-95760489)

Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               11-720, gnl|bosTau2|chr6 (12994119-12993403)
               

               
               11-720, gnl|Hg17|chr4 (95759159-95760489)

	11-720, gnl\|bosTau2\|chr6 (12994119-12993403)
	11-720, gnl\|Hg17\|chr4 (95759159-95760489)