Ss1.1-Pig3-SRG8024D05.5
               |  | CTTTCCCTTGTCTTCCTGCCTCTCTGAGATAACATTTGTAGAATAAACGGAGTGAATCCT
CAAGGCTTTGGGGATCCTTTGAGGCTGCATTAAGTTAAGAATGCCTTTCCTTATGTCTCC
TGAATGGAAATTTGTGCCGAGGTGATTTGTGCTAAGGTCAAGGAGCAGGTTANAGAACCT
GACATCCATTATTTGCCTTGGATACAATGGCTTATTTTTGAAAAGAAATTCATAATAAGG
TGGGGGAGAGGAGAAATGTCCTTATGTTTGAGGACCATGAAATATGGTAGGTATACATAG
GGCTTTAAGAAGTGAGCATAGGCTCTTTCTGCTGCCGGTGAGCAAATGCTCTGGAAAGAA
ACATGACTAAAGAAGTGTGTGTGATATATGATGTGTGTGTGCACACATCCGTGTGTGTGT
GTGTGTATGCATGCGTGAGTGTGCACATGTTTGTATCTGTGTTTGTTCCTTTCTCCCTAT
TANGGAGTTATGCAAAATTTGTCCCAGATTTTATCTTTGTCTTTCTCTGTGTTTTTCAAA
GAGTCCTAAGGAGTTAAATCTTCCAGGTATTTTCCATTTAGTATTGCAGCCAAAGAGTAT
TTAAATAAATGTCTTTGCTGCACTTATATATATGCCCAGCTGATATGCAACTGTAAGCAA
ATGTGTAAAGTCTTCTGTTGGTATGGTTGGTTTCTCATTGAACATATGTAATGATAAAGC
TGGGTCACTCCTGCTTTTGGTGCTCTCACCTTATATGGAAGATCTGCAAACATTACAGAA
ATAGGCTGGCAAGATAAACACTTTCAGAAACCCTCTACTTGCCCATAAGGGTAATGCTGC
ATTTTTCTGTCAGAGTCACATATGAGGTGTGTTCTGTAGAGGTTATTTCTGCATGGAAAC
TCAACTTCTTGGATTAGCAGTCCCAGTGAAAATCCTCACCGCTGGAGTTTAAGCCAAATA
CCAAGCCTTCTTGCAAAGTATCCAGTCTGCCAGAAACTGAGATTTAGGTCTCTTTGGGCC
TATGGTTCTTTCCTCTTTGCTCCCTCTCCAGTCTTGAGATTGGATTTTGCTTTCTAGTAC
AAGTGTAACGAATCCATGTGATAGATGGGAATTTCACTCCCATCTCAACAGGGTCACTTA
GTCATTAACTATAGCCATATAAAT | 
Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz
               |  | CTTTCCCTTGTCTTCCTGCCTCTCTGAGATAACATTTGTAGAATAAACGGAGTGAATCCT
CAAGGCTTTGGGGATCCTTTGAGGCTGCATTAAGTTAAGAATGCCTTTCCTTATGTCTCC
TGAATGGAAATTTGTGCCGAGGTGATTTGTGCTAAGGTCAAGGAGCAGGTTANAGAACCT
GACATCCATTATTTGCCTTGGATACAATGGCTTATTTTTGAAAAGAAATTCATAATAAGG
TGGGGGAGAGGAGAAATGTCCTTATGTTTGAGGACCATGAAATATGGTAGGTATACATAG
GGCTTTAAGAAGTGAGCATAGGCTCTTTCTGCTGCCGGTGAGCAAATGCTCTGGAAAGAA
ACATGACTAAAGAAGTGTGTGTGATATATGATGTGTGTGTGCACACATCCGTGTGTGTGT
GTGTGTATGCATGCGTGAGTGTGCACATGTTTGTATCTGTGTTTGTTCCTTTCTCCCTAT
TANGGAGTTATGCAAAATTTGTCCCAGATTTTATCTTTGTCTTTCTCTGTGTTTTTCAAA
GAGTCCTAAGGAGTTAAATCTTCCAGGTATTTTCCATTTAGTATTGCAGCCAAAGAGTAT
TTAAATAAATGTCTTTGCTGCACTTATATATATGCCCAGCTGATATGCAACTGTAAGCAA
ATGTGTAAAGTCTTCTGTTGGTATGGTTGGTTTCTCATTGAACATATGTAATGATAAAGC
TGGGTCACTCCTGCTTTTGGTGCTCTCACCTTATATGGAAGATCTGCAAACATTACAGAA
ATAGGCTGGCAAGATAAACACTTTCAGAAACCCTCTACTTGCCCATAAGGGTAATGCTGC
ATTTTTCTGTCAGAGTCACATATGAGGTGTGTTCTGTAGAGGTTATTTCTGCATGGAAAC
TCAACTTCTTGGATTAGCAGTCCCAGTGAAAATCCTCACCGCTGGAGTTTAAGCCAAATA
CCAAGCCTTCTTGCAAAGTATCCAGTCTGCCAGAAACTGAGATTTAGGTCTCTTTGGGCC
TATGGTTCTTTCCTCTTTGCTCCCTCTCCAGTCTTGAGATTGGATTTTGCTTTCTAGTAC
AAGTGTAACGAATCCATGTGATAGATGGGAATTTCACTCCCATCTCAACAGGGTCACTTA
GTCATTAACTATAGCCATATAAAT | 
PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map