Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8012I15.3

Sequence:


               
               CTGGAAGAATGACATGTTGATTTAAATTCACATGGAGATGTATCGGCTCCTTCTGTGATG
TACTGGACCATTGGGCTCCAGGGAATATGGATGGGGAGTGAAAAAAAATGGGGCGTTTGA
GACCAGAGGGGCCAGGAATTCTAAGTAGGTGGAGCAGGTTAAAAGACAGACTACATTTAA
CTTAGAATTTTGTTTAGCCTTATTTATCTCAAGCATAACAGACAGAGGTAATTTTTCGTT
TGAGGCTGATGGGAAAGGAGTAATTCAGGCCCAAGAGTGGACCTCCTGCTTGGAGTTTTA
TCCACTAAAACTACAGTGGGATTTTCCACCTGGCAATGCCCTTTACTGAGTGGGACATGC
AGCCCTACCTCTGCGGGACCACTGGTGGCTCAGTGATCATCCCTGCCTGCTCTTCATCTG
CCCAGGTCTCCTTTTCTTGGTACACACAGACCATCAGAAAGTTGATGAATAGAGAAGCAA
GTACCATTTCCCCAAGAGGAGTCTTATGCTCATGCAGCCCAGAATAGTAGTCACCTTGAA
AAAGATTTTTTAAGTCTAGTCCTGCGCCGAAGCTGACTGGAGATAACTTTTCCTAGAATG
GAAATCACCCAACCGGCATGAACTATTTATTTTCTTGATTGCTGCAAGAAAGCACATGAA
CAACAATCTTATTGTCTCCTCCATTTTTGTTTTAAAAGGCATGCAGCTGCTAAGAATGTT
GTGTGTACAAAGCATTAATTAACAACAGCCCCTTTTTATTTATATTTACCCTCTAAAAAT
TTAATTGTTAATTGCTTTTGTGCAGTGCTCAGTTTGTTCCTCTTTCTGTAGATTTGCGTG
CAGTGAAATTAAACATTTTAAAATGTGTAGATGATCGGAGAGGTTTAATTCTCTTGATAT
ATACAGTGACAGTGTTTCAATTCTATAAACAAAACCCACTGGTACAATTAATCATTAACC
TACTTGCGGTAGGGATTAAGGGAGAGAACGAATGTTAACTCTTTTGTGACTTAAGGTAAA
TCAGCAGGAAAGATGATGGAGTGTGTAATTTTTGTTGTCTAAAAATTAACAGCAGTTTGG
TAATCAGAGTATAACGGCCCGAAA

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               CTGGAAGAATGACATGTTGATTTAAATTCACATGGAGATGTATCGGCTCCTTCTGTGATG
TACTGGACCATTGGGCTCCAGGGAATATGGATGGGGAGTGAAAAAAAATGGGGCGTTTGA
GACCAGAGGGGCCAGGAATTCTAAGTAGGTGGAGCAGGTTAAAAGACAGACTACATTTAA
CTTAGAATTTTGTTTAGCCTTATTTATCTCAAGCATAACAGACAGAGGTAATTTTTCGTT
TGAGGCTGATGGGAAAGGAGTAATTCAGGCCCAAGAGTGGACCTCCTGCTTGGAGTTTTA
TCCACTAAAACTACAGTGGGATTTTCCACCTGGCAATGCCCTTTACTGAGTGGGACATGC
AGCCCTACCTCTGCGGGACCACTGGTGGCTCAGTGATCATCCCTGCCTGCTCTTCATCTG
CCCAGGTCTCCTTTTCTTGGTACACACAGACCATCAGAAAGTTGATGAATAGAGAAGCAA
GTACCATTTCCCCAAGAGGAGTCTTATGCTCATGCAGCCCAGAATAGTAGTCACCTTGAA
AAAGATTTTTTAAGTCTAGTCCTGCGCCGAAGCTGACTGGAGATAACTTTTCCTAGAATG
GAAATCACCCAACCGGCATGAACTATTTATTTTCTTGATTGCTGCAAGAAAGCACATGAA
CAACAATCTTATTGTCTCCTCCATTTTTGTTTTAAAAGGCATGCAGCTGCTAAGAATGTT
GTGTGTACAAAGCATTAATTAACAACAGCCCCTTTTTATTTATATTTACCCTCTAAAAAT
TTAATTGTTAATTGCTTTTGTGCAGTGCTCAGTTTGTTCCTCTTTCTGTAGATTTGCGTG
CAGTGAAATTAAACATTTTAAAATGTGTAGATGATCGGAGAGGTTTAATTCTCTTGATAT
ATACAGTGACAGTGTTTCAATTCTATAAACAAAACCCACTGGTACAATTAATCATTAACC
TACTTGCGGTAGGGATTAAGGGAGAGAACGAATGTTAACTCTTTTGTGACTTAAGGTAAA
TCAGCAGGAAAGATGATGGAGTGTGTAATTTTTGTTGTCTAAAAATTAACAGCAGTTTGG
TAATCAGAGTATAACGGCCCGAAA

Aligned organism(s): 5 entry(ies)

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Aligned organism(s): 5 entry(ies)

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               6-205, gnl|bosTau2|chr15 (4315385-4315581)
               

               
               6-205, gnl|Hg17|chr11 (95569756-95569534)
               


               
               460-1094, gnl|bosTau2|chr15 (4316289-4316936)
               

               
               460-1094, gnl|Hg17|chr11 (95569233-95568613)
               

               
               460-1094, gnl|Mm7|chr9 (13366141-13366775)

Aligned organism(s): 5 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               6-205, gnl|bosTau2|chr15 (4315385-4315581)
               

               
               6-205, gnl|Hg17|chr11 (95569756-95569534)
               


               
               460-1094, gnl|bosTau2|chr15 (4316289-4316936)
               

               
               460-1094, gnl|Hg17|chr11 (95569233-95568613)
               

               
               460-1094, gnl|Mm7|chr9 (13366141-13366775)

	6-205, gnl\|bosTau2\|chr15 (4315385-4315581)
	6-205, gnl\|Hg17\|chr11 (95569756-95569534)

	460-1094, gnl\|bosTau2\|chr15 (4316289-4316936)
	460-1094, gnl\|Hg17\|chr11 (95569233-95568613)
	460-1094, gnl\|Mm7\|chr9 (13366141-13366775)