Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8019G08.3

Sequence:


               
               ATTCCCTGGGCTCTTTAAAAGTGTCTGGTTGGACCATTAGCTTTTGATGAATGGGTTTCT
GGAAGGATTGTGACAGCCAGTTAAGTGCTTTGAAAAGAGAATCCCTGAATTGTATCACAC
CTAAATGGCACAAAACATGCTTCTTGGTGCTTGTGTAATTTGGGCTCAAAGGGAAGAGTG
CCATCTACTGAATGGCCAGCATCAAGTTGAGCAGCCCCAAGTTTTTGTTGCGGAACTTTC
AGCAGGCTCCTGGAGAAACCAGACTCAATTTCATCGAAGGATTTGACAGGATCTTAGCAC
CAAGTGGAATTGTTGCTTGCTTAATTTTAATTATGCTTCCCAGCAGGAGGCCTAAACACA
TGATGAAGAAATAATTCACTACTTGGTGGAATGCATGGGAAAGAAACTTGAAGAAGTTGT
TGAGGCTTTATAGTTAAAAACAGTCTAGCAATGGTGAAATCATTGTTAAATTAAAAGTGG
TAAAGAAAATTATTTTAGTAAGGCCTGTTTCATTAGTGGTTCTGGTTATTGATGGCTCCT
GCAGGCAATAATGAGGTTTAAAATTTGGGCTTCACATTGTCAGTCATTTGCTTAACTGGA
GGTAAGGGTTTTAAAAATATTTGGATAATTTGGTTATTTTTTTTCCTTGCCTTTTTCTTT
GTCTCAGGTTCTAAGGCAGTTATATCTACTTGAGTGAATTCACTGTTTCAAAGTGGATTT
TGTTGTTGTTTAGGCTTGCTCAAGTGGCCTCTCGTTTTGTCTTTTGCCATGTTTTCCATG
ACTTCCAGAAACTGCTTGTGGTTATAGCCATGGGTAGAACTGAAGGTAGTAGAACCAGTT
ATGGGTCTGGTGTGGAGATTTATGACACCTGGAATAGCCCCATCAGAGCCCAAGAAAAGG
AATTGAAAGGAAGCTTTGAAATTGTTATAAGAAAGTATTTTTGTTATCTACTATATGTAA
TTAATTAATCATTAACCACTTTTCTCTGCCCTTAAAACCTGCCAGGGATCATGTTAAGCA
CTTTACATAAATTATCTGAAATTTAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCATACAGTTAATAA
GTGGCAGAGCCAAGGCTTGAGCCTGGGGCTAATTCCTTTACTGTGCTATATTGGTATTTA
TTTGAGCTGATTCTAGTTGGTGACTGCACAGAAAACTTGAACGAAGATTAAAATGACGTT
TCTACCTCTCCC

Sequence:

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Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               ATTCCCTGGGCTCTTTAAAAGTGTCTGGTTGGACCATTAGCTTTTGATGAATGGGTTTCT
GGAAGGATTGTGACAGCCAGTTAAGTGCTTTGAAAAGAGAATCCCTGAATTGTATCACAC
CTAAATGGCACAAAACATGCTTCTTGGTGCTTGTGTAATTTGGGCTCAAAGGGAAGAGTG
CCATCTACTGAATGGCCAGCATCAAGTTGAGCAGCCCCAAGTTTTTGTTGCGGAACTTTC
AGCAGGCTCCTGGAGAAACCAGACTCAATTTCATCGAAGGATTTGACAGGATCTTAGCAC
CAAGTGGAATTGTTGCTTGCTTAATTTTAATTATGCTTCCCAGCAGGAGGCCTAAACACA
TGATGAAGAAATAATTCACTACTTGGTGGAATGCATGGGAAAGAAACTTGAAGAAGTTGT
TGAGGCTTTATAGTTAAAAACAGTCTAGCAATGGTGAAATCATTGTTAAATTAAAAGTGG
TAAAGAAAATTATTTTAGTAAGGCCTGTTTCATTAGTGGTTCTGGTTATTGATGGCTCCT
GCAGGCAATAATGAGGTTTAAAATTTGGGCTTCACATTGTCAGTCATTTGCTTAACTGGA
GGTAAGGGTTTTAAAAATATTTGGATAATTTGGTTATTTTTTTTCCTTGCCTTTTTCTTT
GTCTCAGGTTCTAAGGCAGTTATATCTACTTGAGTGAATTCACTGTTTCAAAGTGGATTT
TGTTGTTGTTTAGGCTTGCTCAAGTGGCCTCTCGTTTTGTCTTTTGCCATGTTTTCCATG
ACTTCCAGAAACTGCTTGTGGTTATAGCCATGGGTAGAACTGAAGGTAGTAGAACCAGTT
ATGGGTCTGGTGTGGAGATTTATGACACCTGGAATAGCCCCATCAGAGCCCAAGAAAAGG
AATTGAAAGGAAGCTTTGAAATTGTTATAAGAAAGTATTTTTGTTATCTACTATATGTAA
TTAATTAATCATTAACCACTTTTCTCTGCCCTTAAAACCTGCCAGGGATCATGTTAAGCA
CTTTACATAAATTATCTGAAATTTAGTTAAGTAACTTGCCCAAGATCATACAGTTAATAA
GTGGCAGAGCCAAGGCTTGAGCCTGGGGCTAATTCCTTTACTGTGCTATATTGGTATTTA
TTTGAGCTGATTCTAGTTGGTGACTGCACAGAAAACTTGAACGAAGATTAAAATGACGTT
TCTACCTCTCCC

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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               87-1207, gnl|bosTau2|chr26 (19725219-19724080)
               

               
               87-1207, gnl|Hg17|chr10 (111765850-111767006)
               

               
               87-1207, gnl|Mm7|chr19 (53050025-53051055)

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               87-1207, gnl|bosTau2|chr26 (19725219-19724080)
               

               
               87-1207, gnl|Hg17|chr10 (111765850-111767006)
               

               
               87-1207, gnl|Mm7|chr19 (53050025-53051055)

	87-1207, gnl\|bosTau2\|chr26 (19725219-19724080)
	87-1207, gnl\|Hg17\|chr10 (111765850-111767006)
	87-1207, gnl\|Mm7\|chr19 (53050025-53051055)