Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8023G23.5

Sequence:


               
               GAGGAACCAAGTTTTTACCTTATTTAATTTTAATTTGTTATGTACATGTTGTTGGTTGAA
AAGTACAGATAAAATAAAACAAAATATGCAAGTAATAATAAACAATATATTCTGCACATC
CATGAATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTGTCGATCACTTTGTCCTTCATCTTCCTTACAAG
TGCTTTTAAGTGCAACTCCCATAACTCTCATAACAGTGAGTTCAAATGGCCTTTCCAAGA
AATGATCCTTGCCTTAATAGTAAGGTAGAAGACAGGTCGTATTAAAGTATTTTAGAGTAG
TTATTGCTTCCTTTAATTTAATAATACATCATTTGATATAGATCCAGATGTATCGTAGGT
ATTTTTTTAAGTTAATAGAACAAAACTCAAATAACATCTAAAAATAATTGATCTAGGAAG
ACTGCATTGCATTGCTTGTTCAAATTAAATATAAAATACATTGAAATTTTTATTTTGTAA
ATAGTTTGGCTGTAGTCAGAGTGTCCTTTAGGAATGTTTTAGTATTGATGGATAGACGTT
TAGAATAAGAAGAGACCTTAATCTTGTGTCTATGACAGCCATAGTTGAACTGATACATCT
TCTTTCAAATAAATATTGATTTAATCAGGGCTACATTCCTGTTGGCTCAAAGGTGGTCTT
GATAAAAAGCCTGGGCACTGGGCAACTGACTAACTCAGATCCAGACATAAATATTTTAAA
TGCATGGCCATTCGTTTATAATTATTATTTTTCTTCAAACCTTTCTTCTTTATCTTATAA
CTCCCTTGGTTAATGTTTTTATGCTTTCTGTTAAGTTAAATAATGTGTGTGTCTTCCCTG
TATGTAACATTCAGAGACGGCATGGAATAGGAAAAAACAAAAGTGGTATTTGCATCTGTT
GTTTCCGATTCACAGAGCTGGGAGTGAGGTGCTTAAGCTGACTGTCCACAGAGCTAAGAT
ATCAGTAGGCAGTTTGCTGTAAGCACATGTTCAATTATTAAAATAGTCGACATTTTATGT
CCGATAGCCATGGCAAGGTCACAACATTAATTTATCCAGAGTATTGTGGGCAACTGTCTA

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               GAGGAACCAAGTTTTTACCTTATTTAATTTTAATTTGTTATGTACATGTTGTTGGTTGAA
AAGTACAGATAAAATAAAACAAAATATGCAAGTAATAATAAACAATATATTCTGCACATC
CATGAATTTTGAGTCAAAGTTTGAACTGTCGATCACTTTGTCCTTCATCTTCCTTACAAG
TGCTTTTAAGTGCAACTCCCATAACTCTCATAACAGTGAGTTCAAATGGCCTTTCCAAGA
AATGATCCTTGCCTTAATAGTAAGGTAGAAGACAGGTCGTATTAAAGTATTTTAGAGTAG
TTATTGCTTCCTTTAATTTAATAATACATCATTTGATATAGATCCAGATGTATCGTAGGT
ATTTTTTTAAGTTAATAGAACAAAACTCAAATAACATCTAAAAATAATTGATCTAGGAAG
ACTGCATTGCATTGCTTGTTCAAATTAAATATAAAATACATTGAAATTTTTATTTTGTAA
ATAGTTTGGCTGTAGTCAGAGTGTCCTTTAGGAATGTTTTAGTATTGATGGATAGACGTT
TAGAATAAGAAGAGACCTTAATCTTGTGTCTATGACAGCCATAGTTGAACTGATACATCT
TCTTTCAAATAAATATTGATTTAATCAGGGCTACATTCCTGTTGGCTCAAAGGTGGTCTT
GATAAAAAGCCTGGGCACTGGGCAACTGACTAACTCAGATCCAGACATAAATATTTTAAA
TGCATGGCCATTCGTTTATAATTATTATTTTTCTTCAAACCTTTCTTCTTTATCTTATAA
CTCCCTTGGTTAATGTTTTTATGCTTTCTGTTAAGTTAAATAATGTGTGTGTCTTCCCTG
TATGTAACATTCAGAGACGGCATGGAATAGGAAAAAACAAAAGTGGTATTTGCATCTGTT
GTTTCCGATTCACAGAGCTGGGAGTGAGGTGCTTAAGCTGACTGTCCACAGAGCTAAGAT
ATCAGTAGGCAGTTTGCTGTAAGCACATGTTCAATTATTAAAATAGTCGACATTTTATGT
CCGATAGCCATGGCAAGGTCACAACATTAATTTATCCAGAGTATTGTGGGCAACTGTCTA

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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               1-1080, gnl|bosTau2|chr1 (11954238-11955300)
               

               
               1-1080, gnl|Hg17|chr21 (16879621-16880749)
               

               
               1-1080, gnl|Mm7|chr16 (77638652-77639738)

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               1-1080, gnl|bosTau2|chr1 (11954238-11955300)
               

               
               1-1080, gnl|Hg17|chr21 (16879621-16880749)
               

               
               1-1080, gnl|Mm7|chr16 (77638652-77639738)

	1-1080, gnl\|bosTau2\|chr1 (11954238-11955300)
	1-1080, gnl\|Hg17\|chr21 (16879621-16880749)
	1-1080, gnl\|Mm7\|chr16 (77638652-77639738)