Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8036A04.5

Sequence:


               
               CAGTTCCCAGGCTAGGGGTCAAATCAGAGATGTAGCTGGTGGCCTACACCACAGCCACAG
CAGCGTGGGATCTGAGTTGCGTCTGCTCCCTACACCACAGCTCACAGCAACACCGGACCC
TTAACCCACTGATCAGGGCCCAGGATTGAACCGCATCCTCATGGATACTAGTCAGGTTCG
TTAACCACTGAGCCGAAATGGGAACTCCTTCCCTTTTTTTTTAAAAAAAACTTTTTTTTT
CTTGCTTGTAACAAATATTTCCTGATTGCTATAAAGGCATGGCCAAATTTAAATTCCTTT
TGTAAAACTGATTCCTAATTTTATAATTCTATGAAATTGAATTTATCTAATTTTGTTTGG
GGCTTATTTGCATTTTCCATGTTATTTTATAAACTAAGTGAAGATTTGAGGTCTAAATTA
TATCACAGTGTCACTTAGCCTTTTCTTTTATAATTTGGTTGTTTCAGTTCATCTCCATTC
GTACCCCTTAAAGGACCATCAGGACTTTAGTTTTGTAATTAAGGAGGTTAAATACTAGCC
CCAGCCATTTTTTCTATATTGATTACTGCTGCCAAAAATTATTCTTTTCTCACAGCAGGC
CTGTGTCTATACTGATCTTTAAAAATTTATATTCATAAACAGATTTGTTTGGGTAAGTCA
CACCACCATGTGTCCTATTTTTGTTTTGTTTTGAACTACAACGTCAGCATAATTGTTGGA
AAATTCTCCTTCAGTCCTGCAAAGAAAAACCTGTTTTCAAGTTTAAATGATTTGAACTTA
TGACAAAGTGGC

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               CAGTTCCCAGGCTAGGGGTCAAATCAGAGATGTAGCTGGTGGCCTACACCACAGCCACAG
CAGCGTGGGATCTGAGTTGCGTCTGCTCCCTACACCACAGCTCACAGCAACACCGGACCC
TTAACCCACTGATCAGGGCCCAGGATTGAACCGCATCCTCATGGATACTAGTCAGGTTCG
TTAACCACTGAGCCGAAATGGGAACTCCTTCCCTTTTTTTTTAAAAAAAACTTTTTTTTT
CTTGCTTGTAACAAATATTTCCTGATTGCTATAAAGGCATGGCCAAATTTAAATTCCTTT
TGTAAAACTGATTCCTAATTTTATAATTCTATGAAATTGAATTTATCTAATTTTGTTTGG
GGCTTATTTGCATTTTCCATGTTATTTTATAAACTAAGTGAAGATTTGAGGTCTAAATTA
TATCACAGTGTCACTTAGCCTTTTCTTTTATAATTTGGTTGTTTCAGTTCATCTCCATTC
GTACCCCTTAAAGGACCATCAGGACTTTAGTTTTGTAATTAAGGAGGTTAAATACTAGCC
CCAGCCATTTTTTCTATATTGATTACTGCTGCCAAAAATTATTCTTTTCTCACAGCAGGC
CTGTGTCTATACTGATCTTTAAAAATTTATATTCATAAACAGATTTGTTTGGGTAAGTCA
CACCACCATGTGTCCTATTTTTGTTTTGTTTTGAACTACAACGTCAGCATAATTGTTGGA
AAATTCTCCTTCAGTCCTGCAAAGAAAAACCTGTTTTCAAGTTTAAATGATTTGAACTTA
TGACAAAGTGGC

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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               207-787, gnl|bosTau2|chr26 (103019-102416)
               

               
               207-787, gnl|Hg17|chr10 (59792675-59793221)
               

               
               207-787, gnl|Mm7|chr10 (70862805-70862182)

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               207-787, gnl|bosTau2|chr26 (103019-102416)
               

               
               207-787, gnl|Hg17|chr10 (59792675-59793221)
               

               
               207-787, gnl|Mm7|chr10 (70862805-70862182)

	207-787, gnl\|bosTau2\|chr26 (103019-102416)
	207-787, gnl\|Hg17\|chr10 (59792675-59793221)
	207-787, gnl\|Mm7\|chr10 (70862805-70862182)