Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8037M15.5

Sequence:


               
               GTTTCTAATAAGAAAAGGACACCATGAGATAGCTAAAGACTGCTTGAGGTTACATTTGTT
TATTTAGTTGATATTTTAAGACCTAGTTTGACAAAAGACAACAGTAAAATTTTAATGGAA
GGCCCAGTGTGTGCCAGGCACTGTTAGTGTTTGGGATATATCTATCCGTGAACCAAACAC
AAAATTTCTTGACAGCTCCCTCGGTGAGAATAGCCGATTAACTGAAAACATGCAGGCCCA
GCTCAGCCAAACCCTGGTCTAAGAAGGAACATGAACATTTTCTCTACCATCATGCACATG
TCTGTCCTGGAGAAACCTAGGAATGATGAGAAAGTAACCAAGAGAAAGAGGGATGGACAG
TTGGTGCCATTTGAGAACTCTTTTCTTATTTATATATTTGTTTTTTAAAGAACACTTTTT
TTAAAAAGTACTGTGTACAAATGATCAAGACAGTTGAAATCGTGGTAATCCAAGGCCTGG
GAGAAATGAATTAGACCATAAATTATTTGAAATAGGATAACCATTCTGCAACAGAATTGC
TAATCTCCTAATTAAGATTACCTTTGGTTAAGGCTGTAGTTCAGAATATGTTAATTTTAA
TAAATCAGATTTCTATTATGTGATTTTTTTTTAAGGACAATTTAAGTATAATAATTAGTC
TTATAAGAGCATAGGTCACTACTATATGAAAAAAACAAGTTTTTGTACTTCATAATTTAA
ATAGTCTTTCAAAAAAACAGCTTTGTTGAGGTATAATTTAAATACCTTGACATAGACTCA
TTTTAAGTGAAAATTTCAGTAATTTTTATTAAATTTACAGAGTTGTGCAGTTATCTTCAC
TACTCAATTTTAGAGCATTTCTAATACCCCTTTTGCTCATTTAGATAGGCTTTTGTGAAT
TAATTTGGAAGCAATCTTATAACATTGTTTCCATGGAAATATGTATTCTAAACTAACTTT
TGGATGAATATTTAAAATTAGAGACTGGATATTTATAAATACACTCTATAAGCTAAGATT
AATCATATCTAATTTAGATAAAAATAAATACAGTGTTTATGGTTGTTAAAATGAACACTG
AAGCTCTCCATATTAAAAAAAAAAAGTACCACAATTTTTTTTCCAAGTTATTTCATACTG
CAATGTGTGTGTGCGTGATTTATTGCAATTAAGATGGTTTGTAAAATTGACAGTCTTCCC
TTGATTAGAACAACTGCCAGTAAATATAGTGAATTTGATGACTTTAACAAAGTGTGGTGG
ATTCTTTTGAAATAGGCTCATAAAGATTTTGGGGACAAATGTTGTAACATGATAGCTGCA
GATTCCTTATGG

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               GTTTCTAATAAGAAAAGGACACCATGAGATAGCTAAAGACTGCTTGAGGTTACATTTGTT
TATTTAGTTGATATTTTAAGACCTAGTTTGACAAAAGACAACAGTAAAATTTTAATGGAA
GGCCCAGTGTGTGCCAGGCACTGTTAGTGTTTGGGATATATCTATCCGTGAACCAAACAC
AAAATTTCTTGACAGCTCCCTCGGTGAGAATAGCCGATTAACTGAAAACATGCAGGCCCA
GCTCAGCCAAACCCTGGTCTAAGAAGGAACATGAACATTTTCTCTACCATCATGCACATG
TCTGTCCTGGAGAAACCTAGGAATGATGAGAAAGTAACCAAGAGAAAGAGGGATGGACAG
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TTAAAAAGTACTGTGTACAAATGATCAAGACAGTTGAAATCGTGGTAATCCAAGGCCTGG
GAGAAATGAATTAGACCATAAATTATTTGAAATAGGATAACCATTCTGCAACAGAATTGC
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TAAATCAGATTTCTATTATGTGATTTTTTTTTAAGGACAATTTAAGTATAATAATTAGTC
TTATAAGAGCATAGGTCACTACTATATGAAAAAAACAAGTTTTTGTACTTCATAATTTAA
ATAGTCTTTCAAAAAAACAGCTTTGTTGAGGTATAATTTAAATACCTTGACATAGACTCA
TTTTAAGTGAAAATTTCAGTAATTTTTATTAAATTTACAGAGTTGTGCAGTTATCTTCAC
TACTCAATTTTAGAGCATTTCTAATACCCCTTTTGCTCATTTAGATAGGCTTTTGTGAAT
TAATTTGGAAGCAATCTTATAACATTGTTTCCATGGAAATATGTATTCTAAACTAACTTT
TGGATGAATATTTAAAATTAGAGACTGGATATTTATAAATACACTCTATAAGCTAAGATT
AATCATATCTAATTTAGATAAAAATAAATACAGTGTTTATGGTTGTTAAAATGAACACTG
AAGCTCTCCATATTAAAAAAAAAAAGTACCACAATTTTTTTTCCAAGTTATTTCATACTG
CAATGTGTGTGTGCGTGATTTATTGCAATTAAGATGGTTTGTAAAATTGACAGTCTTCCC
TTGATTAGAACAACTGCCAGTAAATATAGTGAATTTGATGACTTTAACAAAGTGTGGTGG
ATTCTTTTGAAATAGGCTCATAAAGATTTTGGGGACAAATGTTGTAACATGATAGCTGCA
GATTCCTTATGG

Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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               3-1311, gnl|bosTau2|chr1 (77490347-77489014)
               

               
               3-1311, gnl|Hg17|chr3 (147318366-147317251)

Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               3-1311, gnl|bosTau2|chr1 (77490347-77489014)
               

               
               3-1311, gnl|Hg17|chr3 (147318366-147317251)

	3-1311, gnl\|bosTau2\|chr1 (77490347-77489014)
	3-1311, gnl\|Hg17\|chr3 (147318366-147317251)