Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8038I04.3

Sequence:


               
               CCAAATTGCTGGTAGACTTAATATAACCTGTATTATGGTGATTTTAGTACTGTTTGTGGT
TGACAGAGGCATTAAATTGTTATATGACTGTTAGCAAGTTATAAAGACAACGCAAAAGAT
AGTGGCATAGAGTGTTGGTTAAAGCTATAGGTTTTTATTTGAGGCCTTTGTAATCAGCAT
GAAAACAGGAAATTGAAGTTTCTATTTGTGTTTTTGCTTTTAAGTGTTTTTTTCTCTTTA
TTTAAAGGAGTGACATGCTTTATAGGATACTATGCAGTGCTTTTTATTAATTATGTTGAA
TAAATGTTGGGATTTGTAGTAGTCACTACTTTCCAACCATTTTTAAGTAGACTTTTTTGA
TATCAAAATATTTGTTAGACAAAAGCTGGAAATTTTTATTTTAAATTGATTTGGAACATT
TGTTAAATTTATATATGTTTTTTCCAAAGTGAAAGTGAATCATGGAAGAAAAGTTAATTT
ATGTGGTAATTATTTAACTTTAAAAAGTATATGTAATTTATCTGATTGTCATGTGACTTA
ATTCAGTTACTAGTGTGAATATAACTGAATATAATAAGAAAAATTGTATAAACTGAATTA
TTTTCAAAAGTGTTTTAGTTGATTCTGCTACATTTCTGTTTAGTCTTTTGGATCATATAT
CTCTCTTATTTCCAGAGTTCTAGGCATTGTCACAGGTGAAGACCTTTGACTCAATAGCAA
TCATTATAGTGAAAGTTAGAAGAAAAAAAATCACCATTTCAGTAATACTGTTATGAGACC
TCTCCCATCATGCTTTGACTTTTAAAAGGCCTTTGTACCTATCATCTAGAAGAAAATATG
TATGATGCTATAACTGGTCTAATCAGTGACTGGAAAAAGCATTAGGAACAGAATATCCCA
AAGTTTTAGTACTTAATTTTCTCACACATAAAAATCTTGTATTGGCCTCAGCAAACTATT
TGGAAAAGAAGCAAGATACTTAATGAAATGCAAGAGGAATTCTAAAGCACAAGAAATATT
GGGGTTGTAGTTAATCGTTTTTAATATAACATTTTAGCTTTTGCCCATATAAAGCACAGT
TAGTAATTAGGCTAATTCTTTCCAGTATTCCATTTAAGTCTCTGCTACATACTGCTCTAA
TTTTTTAGCACTCTGTAATATGTATCTTACTTGCAGCTGGTTGGCACTGTTAACCCACAG
GAACTCCAGAACGTTATCAGTCTCTGCTACTTCCTGGGCATTCATCTG

Sequence:

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Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               CCAAATTGCTGGTAGACTTAATATAACCTGTATTATGGTGATTTTAGTACTGTTTGTGGT
TGACAGAGGCATTAAATTGTTATATGACTGTTAGCAAGTTATAAAGACAACGCAAAAGAT
AGTGGCATAGAGTGTTGGTTAAAGCTATAGGTTTTTATTTGAGGCCTTTGTAATCAGCAT
GAAAACAGGAAATTGAAGTTTCTATTTGTGTTTTTGCTTTTAAGTGTTTTTTTCTCTTTA
TTTAAAGGAGTGACATGCTTTATAGGATACTATGCAGTGCTTTTTATTAATTATGTTGAA
TAAATGTTGGGATTTGTAGTAGTCACTACTTTCCAACCATTTTTAAGTAGACTTTTTTGA
TATCAAAATATTTGTTAGACAAAAGCTGGAAATTTTTATTTTAAATTGATTTGGAACATT
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ATTCAGTTACTAGTGTGAATATAACTGAATATAATAAGAAAAATTGTATAAACTGAATTA
TTTTCAAAAGTGTTTTAGTTGATTCTGCTACATTTCTGTTTAGTCTTTTGGATCATATAT
CTCTCTTATTTCCAGAGTTCTAGGCATTGTCACAGGTGAAGACCTTTGACTCAATAGCAA
TCATTATAGTGAAAGTTAGAAGAAAAAAAATCACCATTTCAGTAATACTGTTATGAGACC
TCTCCCATCATGCTTTGACTTTTAAAAGGCCTTTGTACCTATCATCTAGAAGAAAATATG
TATGATGCTATAACTGGTCTAATCAGTGACTGGAAAAAGCATTAGGAACAGAATATCCCA
AAGTTTTAGTACTTAATTTTCTCACACATAAAAATCTTGTATTGGCCTCAGCAAACTATT
TGGAAAAGAAGCAAGATACTTAATGAAATGCAAGAGGAATTCTAAAGCACAAGAAATATT
GGGGTTGTAGTTAATCGTTTTTAATATAACATTTTAGCTTTTGCCCATATAAAGCACAGT
TAGTAATTAGGCTAATTCTTTCCAGTATTCCATTTAAGTCTCTGCTACATACTGCTCTAA
TTTTTTAGCACTCTGTAATATGTATCTTACTTGCAGCTGGTTGGCACTGTTAACCCACAG
GAACTCCAGAACGTTATCAGTCTCTGCTACTTCCTGGGCATTCATCTG

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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               1-1248, gnl|bosTau2|chr1 (62163888-62165123)
               

               
               1-1248, gnl|Hg17|chr3 (172093287-172091683)
               

               
               1-1248, gnl|Mm7|chr3 (28610694-28611905)

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               1-1248, gnl|bosTau2|chr1 (62163888-62165123)
               

               
               1-1248, gnl|Hg17|chr3 (172093287-172091683)
               

               
               1-1248, gnl|Mm7|chr3 (28610694-28611905)

	1-1248, gnl\|bosTau2\|chr1 (62163888-62165123)
	1-1248, gnl\|Hg17\|chr3 (172093287-172091683)
	1-1248, gnl\|Mm7\|chr3 (28610694-28611905)