Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8040A14.5

Sequence:


               
               GAAAAATGTCGGTGCCCAATGAAAGACGGGTGCTTTTTAGCTAGAGCTTACCAGCGGGCC
ACGTCTGGGTTTGCGGCCCCAAATGGTGTAAACGCTGCTGTACGAGGAGTCGATATCAGG
AGTGTCTTAATTAGAATTTAGTGATATAGGAAATAAATGAGCAGTGACACATTTCGTGAC
ATCATTTTTTCCTCAAAGATGCCCAGAGTTTTAAGCTGCATTTAAGAATGACCTACATTT
TGCCAGAAAGTAAATCTTTTTAAGTAAACCGCTTGCTAAAGCCCAGAGAGGTAAGTGTAA
GCTACCACCCGAGATCCTTTAGTTTTCTGTTGAGGCTTGTGCGGGTGACTAGGGTGAGGA
TGCCTTATATTTTTAATTTTCCAGATGGCCAGAGCATTTGATGTGTACGTGATAAGGTAA
TGTTCAAGGCGAATGGAAGACCCGAGGACTTTTTGATAAGTAATGTTCACTTGACACTTT
TAGCCTAAAATAACTGTAATTAGTTTAAAGTGGGAATTAGAGCCCCGTGTTTTAGACTTT
TTTTGGTCAGAAGCTATATGGGGAAAAGCGTTTTTTAACAATTTTTAAGCAACCCCCTTT
ACTGTCATTTGCAAAGTATTGAATTTGAAATAGCCTGGCCTGGAACTTGGAGCTAAACAA
GCAAACAATTTACATGTGATTTGACATTTGCTATTTAAAGGCTTTGAGAGCTAATAACAG
AATTAAAAGGAATGGATATAAATAATAAAATTTCTTGTTGACTCTCCGGAGCCTGCCTAG
GGGGGAGCGACAGATGACATGGTGGTGACTTTGAGCCATTCCCTGCAGACAGCAGTTGTG
AATGTGGTCGGTCAGTGTTCCTTTGAAAAATGAAGGGCAAGTAGGTTTATGGAGCAAATC
TAGAAACAAATATTTAACCACACAGGATTTTCGCAAGAGTCGAGACTAAAAGTTTTGTAT
TTTAAATTTAACAATAAACATTTCTTCATTGATTAATGTAATTCAAAAGGAAACTTTATG
CTTGTATTATTTTGTTCTGTGTTCGTACTTCAGACTGAAGTTCATCTGTCCTTCAGGAAA
AAATATTTTCATAGCTATTAAAAACATCAAGACTAGTACTTTCAACTTTCTTCAGGTAGC
TATAGGATTGCTGTAATTTTTAGTTTCTTAATTTTAAACAAGATTAGCACAGCCCTATTT
AAGGAGTTTGGTTTATTCCAAAACTATAAGTGTGGTCTATATAAAATTGTAATATCAAAA
GTTTTTGTAAAGAAACTTTTAATGAATATTAAACGTATTTTAAGGGGATTCTCTCACACT
ATTCCCCCCTTCCAAAGAAAAATCAGAGTTTTCCATTTGATAGAAATATCATAATCAGGT
ATAAGAAAATGATTACCATAATAACAGGTCTGTCAAGATGGTGGATACATTTGAATGTAT
TTTGAAGAAAAAAGAATATTCTCAGCTCTTTATACGTTTGAAGTACTTGAAAAGGCATGG
AGAAGTTTGTAAAAACATTTTATTACTGAAATATACAAGACCATTAAAATGTGCAAGTAA

Sequence:

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Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               GAAAAATGTCGGTGCCCAATGAAAGACGGGTGCTTTTTAGCTAGAGCTTACCAGCGGGCC
ACGTCTGGGTTTGCGGCCCCAAATGGTGTAAACGCTGCTGTACGAGGAGTCGATATCAGG
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AGAAGTTTGTAAAAACATTTTATTACTGAAATATACAAGACCATTAAAATGTGCAAGTAA

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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               7-1560, gnl|bosTau2|chr2 (11332147-11330607)
               

               
               7-1560, gnl|Hg17|chr2 (177327636-177326087)
               

               
               7-1560, gnl|Mm7|chr2 (74980918-74979428)

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               7-1560, gnl|bosTau2|chr2 (11332147-11330607)
               

               
               7-1560, gnl|Hg17|chr2 (177327636-177326087)
               

               
               7-1560, gnl|Mm7|chr2 (74980918-74979428)

	7-1560, gnl\|bosTau2\|chr2 (11332147-11330607)
	7-1560, gnl\|Hg17\|chr2 (177327636-177326087)
	7-1560, gnl\|Mm7\|chr2 (74980918-74979428)