Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8047H13.5

Sequence:


               
               GTTTCTTGGTAAATGTGGTTAAAAAATTTTTAAAAACATAGACAAGCTACAAAATAGCAT
TTCTTGTATGATACTTGTTAGTATGATTTTAGTTCCCTCTACTTAAAGAGTTGGTCAAAT
GTAACGACTCAATTGTAGCTGGACAGAGTAAGGAACTCCAGCATCCTCTCTGTTCAGTCC
CATCTTCTGCCTCAGATCAAACCCTCAGTGCTAGCTGTGGACAGCACCTGGCCACACTGT
GACCAAAGCCCTAAGTACCCCTCTTGCCTCCCTGTGCTTCGGGATCAGCCCCCGCCCCCA
ACCCCCTGTGGTTGCCAATGGGAGAAATTCTGGGAAGACAGGCATCCTGACCAGCAACCT
GCTAGACCAAAGCATCTTAAGGGGTTTGAAGTAAGGGGGTGACAGAGGGAAGAATATGAA
CTCCCCTAAGTCAGCATTAATTTAACCTTTGTGCCACCTGCCAAAAGAACCTGGAGAAAC
TTTACCATATTCAAGAAATTAAACAGAATTAGTGTTTTAAGCCAGGTGTTTAAAGAACAC
CTCCTCCTCACTCCCCATTTTTGCAATGCTCCGAGTGAGTTTCAATGTGTCAGGATGGAC
GGACCCAAGATCCAATGAATGATTCAGCCAATCCAAGACCTGAATTTTCTTTCCTTCATC
ATCCATCCTCATTCAGTGTAACGTCTTGTATAATTGTGATTAATTCTATGTAAAAAGTTT
ACTTAAAAAATATGTGCCTATGTAATAAAGTCTACACACTGGTTAACTGTATAGAATAAG
GTTTTGTTTTTAATTGTTCTGCTCAACATCTGTAATACCCTTTTTTGAACTATGAAAAAG
TGCTATTAAAAATTTTAAACAAAATCTGTCACTCTGCAAGATTTAATGAGGTCAGGCATA
ATGAAAAATGTCTATTATTAAAAAGATTCATCATCCAGTTAATATGGTTAATGATCATAA
GCTGACAAGTTAACAAGTGACCTGTATCCTAGTTAAGTTTATCATGTATATACTTTAATC
AATTCAAGATAGATATAATGTATTCTTATTTTGTGCCAAATTCAGTGA

Sequence:

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Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               GTTTCTTGGTAAATGTGGTTAAAAAATTTTTAAAAACATAGACAAGCTACAAAATAGCAT
TTCTTGTATGATACTTGTTAGTATGATTTTAGTTCCCTCTACTTAAAGAGTTGGTCAAAT
GTAACGACTCAATTGTAGCTGGACAGAGTAAGGAACTCCAGCATCCTCTCTGTTCAGTCC
CATCTTCTGCCTCAGATCAAACCCTCAGTGCTAGCTGTGGACAGCACCTGGCCACACTGT
GACCAAAGCCCTAAGTACCCCTCTTGCCTCCCTGTGCTTCGGGATCAGCCCCCGCCCCCA
ACCCCCTGTGGTTGCCAATGGGAGAAATTCTGGGAAGACAGGCATCCTGACCAGCAACCT
GCTAGACCAAAGCATCTTAAGGGGTTTGAAGTAAGGGGGTGACAGAGGGAAGAATATGAA
CTCCCCTAAGTCAGCATTAATTTAACCTTTGTGCCACCTGCCAAAAGAACCTGGAGAAAC
TTTACCATATTCAAGAAATTAAACAGAATTAGTGTTTTAAGCCAGGTGTTTAAAGAACAC
CTCCTCCTCACTCCCCATTTTTGCAATGCTCCGAGTGAGTTTCAATGTGTCAGGATGGAC
GGACCCAAGATCCAATGAATGATTCAGCCAATCCAAGACCTGAATTTTCTTTCCTTCATC
ATCCATCCTCATTCAGTGTAACGTCTTGTATAATTGTGATTAATTCTATGTAAAAAGTTT
ACTTAAAAAATATGTGCCTATGTAATAAAGTCTACACACTGGTTAACTGTATAGAATAAG
GTTTTGTTTTTAATTGTTCTGCTCAACATCTGTAATACCCTTTTTTGAACTATGAAAAAG
TGCTATTAAAAATTTTAAACAAAATCTGTCACTCTGCAAGATTTAATGAGGTCAGGCATA
ATGAAAAATGTCTATTATTAAAAAGATTCATCATCCAGTTAATATGGTTAATGATCATAA
GCTGACAAGTTAACAAGTGACCTGTATCCTAGTTAAGTTTATCATGTATATACTTTAATC
AATTCAAGATAGATATAATGTATTCTTATTTTGTGCCAAATTCAGTGA

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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               8-1066, gnl|bosTau2|chr10 (64311890-64310833)
               

               
               8-1066, gnl|Hg17|chr14 (80797616-80796563)
               

               
               8-1066, gnl|Mm7|chr12 (89115438-89114354)

Aligned organism(s): 3 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               8-1066, gnl|bosTau2|chr10 (64311890-64310833)
               

               
               8-1066, gnl|Hg17|chr14 (80797616-80796563)
               

               
               8-1066, gnl|Mm7|chr12 (89115438-89114354)

	8-1066, gnl\|bosTau2\|chr10 (64311890-64310833)
	8-1066, gnl\|Hg17\|chr14 (80797616-80796563)
	8-1066, gnl\|Mm7\|chr12 (89115438-89114354)