Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Pig4-TMW8059P12.5

Sequence:


               
               CTCCCCCACACCCTGCTTTTAAGATACTGTTTTTACCAGTTCAGTTTCCATTTGGAAAGG
TTAACTGATTTGGTTTCAATCTGTGTTAAGCAATAGATGTGAGTTCTCTAAAAGCTTCTT
TTTCTCTCATGTTTTTAAGGAATTTGCCTTTTTGCGCTTAAAAATATGCTTGAAAGGGAA
AAAAAAATCCTTTTCTAAATGTGTCCTTTCCTATGACCTTTTGTAAAATGCTCAATCATG
TGGCAGAAATGCAACTACTTGGTCCCTCTCCCCCACCTCATTAGTGCTTCTTTGTGTTCT
GAGGAGGAAATAGATGGATGAAGTTAAGGAGTTCTCTTGTGGCACAGTGGGCTAAGCATC
AGGCGTTGTCACTGTAGCAGGTGGAACGTGATATGGTACAGATGTAATCCTGGTCTGGGA
ACTTGCACATGCCATGGGTGTGGCCTAAAAAAATTTTGTTTGATACCCACTGATTCTTCA
ACCATATTCATAATTAGTTTCTTGCTTCCGTCTTAAAACTGTATGGAGAAGAGAGAACTG
CATGGTTCCAATAGGTGGACAATCCAGAAGCTCTCATTACACATTTTCAATTGGATCAGT
ATCTGACAGGCAGTGACAAGGTTGCACAGTGGTTTTCAACTTTGTAATTAGTGTAGTGGT
GGATTACTGACCAGCCCTAAATGTAGTGGTTAAGGATGATTATCAGGTTTTTAAATGTAC
TGACAGTTTGAATTCTTGAGTACTGTGTTATTTATTGTGCAGTTTAAAATTGTCTTGTTT
TGGAGTTCCTGCTGTGGCGCAGTGGGTTAATGATCCAGCTTTGCTGCAGCTGTGGCTTCA
GATTCGATACCTGGCCCCAGAACTTCTCTATGCTGCAGGTGTGGCTGAAAAAGAAAAAAA
TGTTTCCTTTTCAAGAAGGCTGCAGTGATACATGCAACTGCTTTTCTGAGAAATGTGGAA
TCTAAAAACTGAGGATTTTTGTTAGATCATTTAGCTAAAAACCAAAATGTAAACTCTGTG
AAAATTAGGTGGAAGTGACCAACTGATTTGCAACGCTTGAAAACGCAGAGCTCGTGTAGA
ATGAAATAATGTAGTTCTTTGTTCAGTTTTTTAATAATGATGATGTTATTTTGCTGTTAA
TAAATTTTTTCCCCTTTTTAAATTTTGAGTTCCTAATTTTCTGCTTAGAAATATTTTGGT
AATTCAGTGTTTTTATATTCAGGACTTTGTCATTAACATTATAATATTTTTAAATAATTA
TGAAACAATTACTCTTTTTCTAACTAGGAAGAAGCATTGCATGCATTTATACAGCCAGAG
ATCCTAGACGGC

Sequence:

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Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               CTCCCCCACACCCTGCTTTTAAGATACTGTTTTTACCAGTTCAGTTTCCATTTGGAAAGG
TTAACTGATTTGGTTTCAATCTGTGTTAAGCAATAGATGTGAGTTCTCTAAAAGCTTCTT
TTTCTCTCATGTTTTTAAGGAATTTGCCTTTTTGCGCTTAAAAATATGCTTGAAAGGGAA
AAAAAAATCCTTTTCTAAATGTGTCCTTTCCTATGACCTTTTGTAAAATGCTCAATCATG
TGGCAGAAATGCAACTACTTGGTCCCTCTCCCCCACCTCATTAGTGCTTCTTTGTGTTCT
GAGGAGGAAATAGATGGATGAAGTTAAGGAGTTCTCTTGTGGCACAGTGGGCTAAGCATC
AGGCGTTGTCACTGTAGCAGGTGGAACGTGATATGGTACAGATGTAATCCTGGTCTGGGA
ACTTGCACATGCCATGGGTGTGGCCTAAAAAAATTTTGTTTGATACCCACTGATTCTTCA
ACCATATTCATAATTAGTTTCTTGCTTCCGTCTTAAAACTGTATGGAGAAGAGAGAACTG
CATGGTTCCAATAGGTGGACAATCCAGAAGCTCTCATTACACATTTTCAATTGGATCAGT
ATCTGACAGGCAGTGACAAGGTTGCACAGTGGTTTTCAACTTTGTAATTAGTGTAGTGGT
GGATTACTGACCAGCCCTAAATGTAGTGGTTAAGGATGATTATCAGGTTTTTAAATGTAC
TGACAGTTTGAATTCTTGAGTACTGTGTTATTTATTGTGCAGTTTAAAATTGTCTTGTTT
TGGAGTTCCTGCTGTGGCGCAGTGGGTTAATGATCCAGCTTTGCTGCAGCTGTGGCTTCA
GATTCGATACCTGGCCCCAGAACTTCTCTATGCTGCAGGTGTGGCTGAAAAAGAAAAAAA
TGTTTCCTTTTCAAGAAGGCTGCAGTGATACATGCAACTGCTTTTCTGAGAAATGTGGAA
TCTAAAAACTGAGGATTTTTGTTAGATCATTTAGCTAAAAACCAAAATGTAAACTCTGTG
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ATGAAATAATGTAGTTCTTTGTTCAGTTTTTTAATAATGATGATGTTATTTTGCTGTTAA
TAAATTTTTTCCCCTTTTTAAATTTTGAGTTCCTAATTTTCTGCTTAGAAATATTTTGGT
AATTCAGTGTTTTTATATTCAGGACTTTGTCATTAACATTATAATATTTTTAAATAATTA
TGAAACAATTACTCTTTTTCTAACTAGGAAGAAGCATTGCATGCATTTATACAGCCAGAG
ATCCTAGACGGC

Aligned organism(s): 6 entry(ies)

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Aligned organism(s): 6 entry(ies)

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               31-326, gnl|bosTau2|chr15 (26080922-26081220)
               

               
               31-326, gnl|Hg17|chr11 (11896944-11897224)
               


               
               459-781, gnl|bosTau2|chr15 (26083177-26083494)
               

               
               459-781, gnl|Hg17|chr11 (11897580-11897906)
               


               
               897-1332, gnl|bosTau2|chr15 (26083479-26083912)
               

               
               897-1332, gnl|Hg17|chr11 (11897892-11898323)

Aligned organism(s): 6 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               31-326, gnl|bosTau2|chr15 (26080922-26081220)
               

               
               31-326, gnl|Hg17|chr11 (11896944-11897224)
               


               
               459-781, gnl|bosTau2|chr15 (26083177-26083494)
               

               
               459-781, gnl|Hg17|chr11 (11897580-11897906)
               


               
               897-1332, gnl|bosTau2|chr15 (26083479-26083912)
               

               
               897-1332, gnl|Hg17|chr11 (11897892-11898323)

	31-326, gnl\|bosTau2\|chr15 (26080922-26081220)
	31-326, gnl\|Hg17\|chr11 (11896944-11897224)

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	897-1332, gnl\|bosTau2\|chr15 (26083479-26083912)
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