Non-Coding RNA Search

Ss1.1-Thy1-THY010021A03.5

Sequence:


               
               GTCACAAAAGGTGAGTCTTTAGAACACTTCTGGTTTTTTTGTTGGTTTCTTTTGCTTGAC
CACAGCTATCTTTGGGGAAGAGGTGGGTGGAGGAAGCAGCTTATTTATTCATTTTCCAAT
AATGTTAGTAGTTTACATGTATGAAATAGATTCCAAGATCACATTTTATTAAATACTTTA
TTAAATTTTTGTGGAATACTAAATTTTTTACTAAGAGAATGATTATCAGTAACCCATGTC
TAAGTCCCTTCTAATGACACTGTTTGGGATTGAATCACTCTACTCTGTTATTTTCATTAT
TCTTTTTTATCTTTATTCCTTAAAGTGTTAATGTGACATAACTTTAAATAGTCAAGCGAA
TAGATGGTGACAGTTTTTATAGAACTGTTTGATGACCCTTAAGAGTTGGTCAGCACGTCC
ATGCAGTTGTCAAACCAGAACCGGAAGTTACTTCTCTAAACAGTCTTAAACTTTTATCCA
TCATTTAATTTATGAATGGCTTTGAAGGCAGTCTTTGATACTAAGAAAACATGAAGTTTT
AGATTAATTAAGCTAGAATCAAAAAACAAAATCCTCAAAATTTAATATTTATCTCACCTG
CCTTTGAACACAGTATAGACTAAATTGAAAGTTGGTGACTGTTTCATTTCTTTAGAGTAA
GAACACAATCTTAATTCTACTTTACTATCTGTGAACTTGCCCTAAGCTAAGGTCCTGGCT
GTAGACAAGAGATGTTGAAGCCTTACGTGGTAGGTAACTTAAACATCTTTTATCTTTTGG
ATAGGTGGCCAGAATTTCAGTGGCTACAGCTGCCTCTTGTTCCTACAGGATATTTAATAC
CAGCCTTCTTTCTAACCTGTATGTCCTAAAGCTTTGATGAAGTGGTTGTAGAATTCATTA
ACTAAACCTAATTGGTTTTTTTTTTTTTTTCCAAATGAGATAAATTAGTTACTGGCTCTT
TGGGGGGCAAGTCACCATGAATGTCCTTGAAATATTTCCCACTTTAAAAATATTCTTTCG
GATTTATTAAAAATTGTATTTAAGTAGACAGTAGGTATTGTGTATCAAGGTTTGCCTGAA
AACAATAATAATGCTTTTTTTTTGGCCAAGAAATAGCAAAAAGACATA

Sequence:

Distiller database | Help | Less info

Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz


               
               GTCACAAAAGGTGAGTCTTTAGAACACTTCTGGTTTTTTTGTTGGTTTCTTTTGCTTGAC
CACAGCTATCTTTGGGGAAGAGGTGGGTGGAGGAAGCAGCTTATTTATTCATTTTCCAAT
AATGTTAGTAGTTTACATGTATGAAATAGATTCCAAGATCACATTTTATTAAATACTTTA
TTAAATTTTTGTGGAATACTAAATTTTTTACTAAGAGAATGATTATCAGTAACCCATGTC
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TCTTTTTTATCTTTATTCCTTAAAGTGTTAATGTGACATAACTTTAAATAGTCAAGCGAA
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CCTTTGAACACAGTATAGACTAAATTGAAAGTTGGTGACTGTTTCATTTCTTTAGAGTAA
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GTAGACAAGAGATGTTGAAGCCTTACGTGGTAGGTAACTTAAACATCTTTTATCTTTTGG
ATAGGTGGCCAGAATTTCAGTGGCTACAGCTGCCTCTTGTTCCTACAGGATATTTAATAC
CAGCCTTCTTTCTAACCTGTATGTCCTAAAGCTTTGATGAAGTGGTTGTAGAATTCATTA
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TGGGGGGCAAGTCACCATGAATGTCCTTGAAATATTTCCCACTTTAAAAATATTCTTTCG
GATTTATTAAAAATTGTATTTAAGTAGACAGTAGGTATTGTGTATCAAGGTTTGCCTGAA
AACAATAATAATGCTTTTTTTTTGGCCAAGAAATAGCAAAAAGACATA

Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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               4-1099, gnl|bosTau2|chr17 (33696444-33695349)
               

               
               4-1099, gnl|Hg17|chr12 (114997200-114995795)

Aligned organism(s): 2 entry(ies)

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PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map


               
               4-1099, gnl|bosTau2|chr17 (33696444-33695349)
               

               
               4-1099, gnl|Hg17|chr12 (114997200-114995795)

	4-1099, gnl\|bosTau2\|chr17 (33696444-33695349)
	4-1099, gnl\|Hg17\|chr12 (114997200-114995795)