Tra1-TCH01F110093
|
tccactcccctgtcaatggacatttgggttgcttccacatcttggctattgtgaataaca
ctgcagtgaacactggggcacagatatatccttgaaacaccagtgatttcattgcctttt
atatatgtctagcagagggattgctggatcatatggtagttttatattcaattttttgag
gaaacttcatactgttttccgcagctgctgcaccaacttcctgcccaccaccagtgcagg
agggttccctttctccatagcctcacaagcacttaccttttctttgtcactatagctatc
ctaacaggtaggaggtgatatctcatggtgattttaatttgcatttccttgatgcttagt
gttgagcacattttcatgtacctgttggccatttctgtgtcttcttcggaaaaatgtcta
ttcgggtcctttgcTCATTTTTTTCAGTCGAGTTGTTTCTTTTGCTATGGAGTTGTCCTT
GTCCTTTGAAGAACTAGATACCAGAAAAATGTAAAATGTCATCTGTGGCTCACCTTAATT
TTAGGCTTTGTGGTCCACGCAGTCTCTGTTACAACTACTCAGCTGTCACTGTGGGGCAAA
AGCAGCCAGAACCCACACGTAAATGAGTGGACATCACTGGGCTCCAATAAAAGTGTATTT
ATATTGATAAAAACAGGCAACTCCATACATGTAACTGAATCACTTTGTCGTACAGCTAGT
TGTTGTAAATCAACTAGCCTTCAGTAAAACTTTAAAACATGAAAAAACCAGAAAAACAAA
GCAGGCAGCTGGCTAGCAGGGGCTGTCATCGGCTGAACCCT
|
Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz
|
tccactcccctgtcaatggacatttgggttgcttccacatcttggctattgtgaataaca
ctgcagtgaacactggggcacagatatatccttgaaacaccagtgatttcattgcctttt
atatatgtctagcagagggattgctggatcatatggtagttttatattcaattttttgag
gaaacttcatactgttttccgcagctgctgcaccaacttcctgcccaccaccagtgcagg
agggttccctttctccatagcctcacaagcacttaccttttctttgtcactatagctatc
ctaacaggtaggaggtgatatctcatggtgattttaatttgcatttccttgatgcttagt
gttgagcacattttcatgtacctgttggccatttctgtgtcttcttcggaaaaatgtcta
ttcgggtcctttgcTCATTTTTTTCAGTCGAGTTGTTTCTTTTGCTATGGAGTTGTCCTT
GTCCTTTGAAGAACTAGATACCAGAAAAATGTAAAATGTCATCTGTGGCTCACCTTAATT
TTAGGCTTTGTGGTCCACGCAGTCTCTGTTACAACTACTCAGCTGTCACTGTGGGGCAAA
AGCAGCCAGAACCCACACGTAAATGAGTGGACATCACTGGGCTCCAATAAAAGTGTATTT
ATATTGATAAAAACAGGCAACTCCATACATGTAACTGAATCACTTTGTCGTACAGCTAGT
TGTTGTAAATCAACTAGCCTTCAGTAAAACTTTAAAACATGAAAAAACCAGAAAAACAAA
GCAGGCAGCTGGCTAGCAGGGGCTGTCATCGGCTGAACCCT
|
PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map