Ss1.1-Pig1-112P23.5
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AACTTCTGTAATAAGAAAGGGTTCTGAAAATGGGTTTTAATATTGTTGGATAGTCTTTTA
CCCTCAGATGACTTATTCATTCTGTTCTTCATAGCCCAGGCTACCAAATCAAGGGTGTGA
TAAATGAATAAATACTGATTTGTAATTAGTGTCATAGTTGACACTTTGCCTATTTGAGGC
ACAGCACAGTATACCTAGATAATTGCTATTTGCTAAATAAGCTTTTTGAGATACTTATTC
CCCTCAAATTTGGGAGTCCTTTGTGCTTTCATCAATTTGAAGATGTTCTATTTCAAGCTA
GAAATGTAACCTTCATTGTTTTCCATTTTAGCTGAAACTTCTCTAACTTCTGGAGAACTC
CTGTGAGCTTAATGATTTAGTATTTTCACTTTCAAAAGGGAAAATAACCCTGAGCAAAGT
AAATTCAAAAGCAGTCTTACCTAGATTTTCCTACCTTGTATTCATGTTGGATATGAGGTT
ATTCAAGATAGTTTTTTGCAGTTTTAAATGTTAGTGCCTCTATTTATTTAAGCCAGTGTT
TCTCAGTCTTTTATTTGCATATCACATAGAAATGGTATGGCCTTGAGGACAAACAAAGGA
ATTTGGAGCCCTTAACAAGTTTGCTCACCTGGCTGTCCCTGAGTGAGTATTGAGGGAGTC
AGGTTGTTGGATTTGTGTGTTTTTTTTAAAAAACCACATAGGCCTTTTAATGTAGTATAA
AATTAGATTATGTTCATTCTTAAGAGTTTGGGCCACAAGTTAGTTGGGTGAAGATCCCAA
AAGGCAACTAAACTAGTTCTCTTAATGCTTATGACAGCTTTGCCATGGAAATTGTTGACT
TTTGACTACTTGCCCTTAATGCTTTGTTCTGTTTTGTCATTTGTGATGTAAGACTTTGAA
TAGCCATGTTTGTTTACTTTTCTCATTTGTTGAATATGGGAAATGAGCAATCTCACCACA
TGCCGTCAGTGTTACTTCAAAGCATTTTAAACATTTATGAACAAAATTTATAAATCTCAT
ATTCACTCAATTTAATCTTAATTATATGTGATTGGCCCTTCATTCCTCACCATGTTCCAT
TTTGAAAAAAACTTACTTTGCAAAAATGTATGGGGAGTTCTCACGTACCCTACTCTCAGC
TTCCCCCAAATGTTTACATTTTACATAACCATGTAACAATTATCAAAAACAGTAAATATT
GGCGTTCCCGTCGTTAACGAATCCAGCTAGGAACCATGAGATTGCGGGTTCCTTCCCTGG
CCTTGCTCAGTGGGTTAAGGATCTGGCGTTACTGTGAGCTGTGGTGTAGGTTGCAGACAT
GGCTCGGATCCCACGTTGCTGTGTCTCTGGCGTAGGCCTCTGGCGTAGGTCGGTGGCTGC
AGCTCCAGTTAGACCTCTAGCCTGGGAATCTCCATATGCCATGGGAGCAGCCCTAGAAAA
GACAACAAAACAAAACAGTAAATATTGATGCAGTGCTACTTACTAACTAATCTACAGACT
TTATGTGGATTGTGCCAGCTGGTCAAGGAATGTCTTTTTTTCTGGCTCAGCCATCCAGTC
TAGGATCCCTCGATGCATTTTGTTGTCACAGGCTGTAGACTGTGAGTTCTTCAATCTTTA
TTTCTTGTAGTTTTGACACTTTTGGAGAGTACCAACTGCCCAGTTATTTTTTTAAAGTGC |
Blue-coloured subsequences are predicted RNA structures by RNAz
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AACTTCTGTAATAAGAAAGGGTTCTGAAAATGGGTTTTAATATTGTTGGATAGTCTTTTA
CCCTCAGATGACTTATTCATTCTGTTCTTCATAGCCCAGGCTACCAAATCAAGGGTGTGA
TAAATGAATAAATACTGATTTGTAATTAGTGTCATAGTTGACACTTTGCCTATTTGAGGC
ACAGCACAGTATACCTAGATAATTGCTATTTGCTAAATAAGCTTTTTGAGATACTTATTC
CCCTCAAATTTGGGAGTCCTTTGTGCTTTCATCAATTTGAAGATGTTCTATTTCAAGCTA
GAAATGTAACCTTCATTGTTTTCCATTTTAGCTGAAACTTCTCTAACTTCTGGAGAACTC
CTGTGAGCTTAATGATTTAGTATTTTCACTTTCAAAAGGGAAAATAACCCTGAGCAAAGT
AAATTCAAAAGCAGTCTTACCTAGATTTTCCTACCTTGTATTCATGTTGGATATGAGGTT
ATTCAAGATAGTTTTTTGCAGTTTTAAATGTTAGTGCCTCTATTTATTTAAGCCAGTGTT
TCTCAGTCTTTTATTTGCATATCACATAGAAATGGTATGGCCTTGAGGACAAACAAAGGA
ATTTGGAGCCCTTAACAAGTTTGCTCACCTGGCTGTCCCTGAGTGAGTATTGAGGGAGTC
AGGTTGTTGGATTTGTGTGTTTTTTTTAAAAAACCACATAGGCCTTTTAATGTAGTATAA
AATTAGATTATGTTCATTCTTAAGAGTTTGGGCCACAAGTTAGTTGGGTGAAGATCCCAA
AAGGCAACTAAACTAGTTCTCTTAATGCTTATGACAGCTTTGCCATGGAAATTGTTGACT
TTTGACTACTTGCCCTTAATGCTTTGTTCTGTTTTGTCATTTGTGATGTAAGACTTTGAA
TAGCCATGTTTGTTTACTTTTCTCATTTGTTGAATATGGGAAATGAGCAATCTCACCACA
TGCCGTCAGTGTTACTTCAAAGCATTTTAAACATTTATGAACAAAATTTATAAATCTCAT
ATTCACTCAATTTAATCTTAATTATATGTGATTGGCCCTTCATTCCTCACCATGTTCCAT
TTTGAAAAAAACTTACTTTGCAAAAATGTATGGGGAGTTCTCACGTACCCTACTCTCAGC
TTCCCCCAAATGTTTACATTTTACATAACCATGTAACAATTATCAAAAACAGTAAATATT
GGCGTTCCCGTCGTTAACGAATCCAGCTAGGAACCATGAGATTGCGGGTTCCTTCCCTGG
CCTTGCTCAGTGGGTTAAGGATCTGGCGTTACTGTGAGCTGTGGTGTAGGTTGCAGACAT
GGCTCGGATCCCACGTTGCTGTGTCTCTGGCGTAGGCCTCTGGCGTAGGTCGGTGGCTGC
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GACAACAAAACAAAACAGTAAATATTGATGCAGTGCTACTTACTAACTAATCTACAGACT
TTATGTGGATTGTGCCAGCTGGTCAAGGAATGTCTTTTTTTCTGGCTCAGCCATCCAGTC
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1-1199, gnl|bosTau2|chr2 (76920136-76921327) |
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1452-1674, gnl|bosTau2|chr2 (76921314-76921530) |
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1452-1674, gnl|canFam2|chr2 (74648652-74648330) |
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1452-1674, gnl|dasNov1|scaffold_33916 (40126-40386) |
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1452-1674, gnl|echTel1|scaffold_180759 (1289-1051) |
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1452-1674, gnl|hg17|chr1 (28919458-28919773) |
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1452-1674, gnl|Hg17|chr1 (28919646-28919841) |
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1452-1674, gnl|mm7|chr4 (131398388-131398069) |
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1452-1674, gnl|rheMac2|chr1 (31509600-31509913) |
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1452-1674, gnl|rn3|chr5 (151071817-151071498) |
PigEST conread start position and end position of the aligned locus,
aligned organism with chromosome (chromosome position)
closely related Artiodactyla cow is linked to the PigEST - Genome Map
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1-1199, gnl|bosTau2|chr2 (76920136-76921327) |
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1452-1674, gnl|bosTau2|chr2 (76921314-76921530) |
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1452-1674, gnl|canFam2|chr2 (74648652-74648330) |
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1452-1674, gnl|dasNov1|scaffold_33916 (40126-40386) |
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1452-1674, gnl|echTel1|scaffold_180759 (1289-1051) |
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1452-1674, gnl|hg17|chr1 (28919458-28919773) |
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1452-1674, gnl|Hg17|chr1 (28919646-28919841) |
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1452-1674, gnl|mm7|chr4 (131398388-131398069) |
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1452-1674, gnl|rheMac2|chr1 (31509600-31509913) |
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1452-1674, gnl|rn3|chr5 (151071817-151071498) |
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spl (0.143184) |
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ova (0.129132) |
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sug (0.127291) |
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spl (0.143184) |
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ova (0.129132) |
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sug (0.127291) |
